35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0426 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  100 
 
 
229 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  75.74 
 
 
226 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  74.15 
 
 
216 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  73.71 
 
 
224 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  69.68 
 
 
211 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  68.39 
 
 
208 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  45.45 
 
 
186 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  38.22 
 
 
507 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  37.22 
 
 
193 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  40.31 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  37.99 
 
 
202 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  38.07 
 
 
426 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  36.87 
 
 
190 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  35.59 
 
 
187 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  34.39 
 
 
188 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  35.03 
 
 
187 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  35.11 
 
 
208 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  32.77 
 
 
401 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  34.9 
 
 
208 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  32.62 
 
 
201 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  32.62 
 
 
201 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  35.56 
 
 
435 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  31.15 
 
 
305 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  33.52 
 
 
194 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  32.61 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  41.46 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  28.42 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  28.25 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  29.48 
 
 
750 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  29.9 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  29.21 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  42.05 
 
 
122 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  34.91 
 
 
168 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00700  transcription regulator, putative  30.52 
 
 
586 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.960163  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94457  predicted protein  22.28 
 
 
386 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>