35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2137 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  100 
 
 
224 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  75.4 
 
 
226 aa  289  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  73.85 
 
 
216 aa  285  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  69.07 
 
 
208 aa  281  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  73.71 
 
 
229 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  69.59 
 
 
211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  45.4 
 
 
186 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  40.12 
 
 
401 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  38.51 
 
 
426 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  37.85 
 
 
507 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  36.63 
 
 
188 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  35.84 
 
 
193 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  38.51 
 
 
190 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  36.05 
 
 
187 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  36.05 
 
 
187 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  37.1 
 
 
202 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  35.84 
 
 
435 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  35.2 
 
 
305 aa  96.7  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  35.6 
 
 
206 aa  95.5  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  35.96 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  36.56 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  36.56 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  35.45 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  31.02 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  34.62 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  32.78 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  29.19 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  42.15 
 
 
130 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  29.96 
 
 
750 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  47.62 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  31.37 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  26.55 
 
 
531 aa  61.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  26.56 
 
 
406 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00700  transcription regulator, putative  27.44 
 
 
586 aa  53.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.960163  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94457  predicted protein  21.69 
 
 
386 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>