33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0660 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  62.64 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  59.44 
 
 
190 aa  203  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  52.13 
 
 
188 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  51.93 
 
 
187 aa  168  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  51.93 
 
 
187 aa  168  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  48.35 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  48.35 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  44.69 
 
 
194 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  40.34 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  37.99 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  40.12 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  37.63 
 
 
208 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  40.94 
 
 
507 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  35.29 
 
 
208 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  35.43 
 
 
226 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  37.08 
 
 
426 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  37.1 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  34.86 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  31.11 
 
 
305 aa  93.6  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  34.18 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  33.68 
 
 
208 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  42.22 
 
 
168 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  36.9 
 
 
435 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  31.02 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  32.57 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  30.86 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  29.38 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  26.88 
 
 
531 aa  63.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  25 
 
 
406 aa  58.5  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  37.21 
 
 
122 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00700  transcription regulator, putative  27.33 
 
 
586 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.960163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  35.38 
 
 
130 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>