31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1288 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  46.15 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  45.64 
 
 		 187 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  44.62 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  48.45 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  48.35 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  44.85 
 
 		 190 aa  161  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  40.5 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  35.47 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  36.46 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  32.62 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  40 
 
 		 507 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  37.1 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  34.9 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  39.01 
 
 		 435 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  34.07 
 
 		 401 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  36.56 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  34.86 
 
 		 305 aa  91.3  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  34.62 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  37.5 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  34.78 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  32.04 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  33.51 
 
 		 426 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  35.71 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  30.39 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  29.89 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  31.67 
 
 		 750 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  27.46 
 
 		 531 aa  52.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  27.69 
 
 		 406 aa  52.4  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>