26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03860 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  100 
 
 
406 aa  840    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  42.5 
 
 
531 aa  245  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  35.64 
 
 
205 aa  113  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00700  transcription regulator, putative  34.78 
 
 
586 aa  83.2  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.960163  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  30.89 
 
 
226 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  28.5 
 
 
187 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  29.9 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  28.27 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  27.88 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  29.56 
 
 
208 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  30.57 
 
 
193 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  26.94 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  28.87 
 
 
305 aa  67  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  29.1 
 
 
186 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  29.47 
 
 
206 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  30.1 
 
 
211 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  29.32 
 
 
216 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  25 
 
 
202 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  24.35 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  26.56 
 
 
224 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  27.69 
 
 
201 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  27.69 
 
 
201 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  27.05 
 
 
194 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  26.63 
 
 
190 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  28.93 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  32.32 
 
 
122 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>