32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2489 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  100 
 
 		 188 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  92.43 
 
 		 187 aa  352  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  91.89 
 
 		 187 aa  350  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  54.12 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  52.13 
 
 		 202 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  44.62 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  44.62 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  50.56 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  44.27 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  44.58 
 
 		 507 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  39.76 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  37.22 
 
 		 426 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  38.64 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  37.79 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  37.91 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  36.78 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  34.39 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  36.63 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  34.33 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  33.7 
 
 		 305 aa  95.1  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  40.12 
 
 		 435 aa  91.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  32.47 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  32.77 
 
 		 401 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  31.69 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  31.58 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  30.1 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  28.95 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  27.88 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  27.43 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  36.78 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  38.2 
 
 		 122 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  35.24 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>