32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4092 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  62.64 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  57.22 
 
 
187 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  57.22 
 
 
187 aa  207  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  54.12 
 
 
188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  53.26 
 
 
190 aa  191  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  48.45 
 
 
201 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  48.45 
 
 
201 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  46.35 
 
 
194 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  39.44 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  37.22 
 
 
229 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  39.43 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  38.29 
 
 
216 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  36.41 
 
 
208 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  36.76 
 
 
426 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  35.84 
 
 
224 aa  104  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  35.84 
 
 
208 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  41.62 
 
 
507 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  35.26 
 
 
186 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  36.5 
 
 
206 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  34.64 
 
 
401 aa  92  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  32.12 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  31.11 
 
 
305 aa  87  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  35.71 
 
 
435 aa  85.1  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  35.2 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  34.95 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  30.11 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  38.95 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  30.57 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  26.78 
 
 
531 aa  68.2  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  29.9 
 
 
750 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00700  transcription regulator, putative  28.95 
 
 
586 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.960163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>