56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0443 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  100 
 
 		 426 aa  882    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  36.62 
 
 		 507 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  36.52 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  38.33 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  38.51 
 
 		 224 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  39.33 
 
 		 226 aa  117  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  39.56 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  37.78 
 
 		 208 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  38.86 
 
 		 216 aa  114  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  37.22 
 
 		 188 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  40.83 
 
 		 186 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  41.86 
 
 		 194 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  36.13 
 
 		 187 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  38.07 
 
 		 229 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  36.13 
 
 		 187 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  34.78 
 
 		 208 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  35.21 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  36.76 
 
 		 193 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  35.52 
 
 		 200 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3640  ParB-like nuclease  31.18 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  36.99 
 
 		 202 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  31.28 
 
 		 206 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  38.6 
 
 		 190 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  33.51 
 
 		 201 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  33.51 
 
 		 201 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  30.89 
 
 		 304 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  33.16 
 
 		 208 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  29.23 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  30.96 
 
 		 750 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  30.34 
 
 		 208 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  28.27 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  26.37 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  39.02 
 
 		 168 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  32.22 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  37.23 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  29.03 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  36.45 
 
 		 122 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  31.68 
 
 		 130 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  32.64 
 
 		 347 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  27.71 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  34.21 
 
 		 333 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00700  transcription regulator, putative  24.16 
 
 		 586 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.960163  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  31.53 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  27.8 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  33.56 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0135  nuclease  33.66 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00112116 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  33.33 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.89 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  28.99 
 
 		 322 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  30.61 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  31.73 
 
 		 328 aa  43.9  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  26.52 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  25.86 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1535  ParB domain protein nuclease  38.16 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  32.67 
 
 		 329 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  31.53 
 
 		 332 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>