261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5556 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 329 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  89.67 
 
 		 329 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  56.44 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  47.69 
 
 		 336 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  45.77 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  43.71 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  42.53 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  40.84 
 
 		 335 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  42.67 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  41.97 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  42.57 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  40.82 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  42.33 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  42 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  41.5 
 
 		 333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  41.14 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  40.96 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  39.67 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  38.37 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  38.86 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  39.48 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  38.79 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  39.92 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  38.46 
 
 		 347 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  38.54 
 
 		 335 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  41.81 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  37.94 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  40.34 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  41.99 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  35.94 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  40.45 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  34.24 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  49.56 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  35.84 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  35.84 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  38.26 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  36.98 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  40.41 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  35.62 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  34.39 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  31.96 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.53 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  34.64 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.31 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  34.03 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  34.89 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  34.04 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  37.37 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  37.06 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  39.27 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  36.88 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.69 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  30.11 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.9 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  27.92 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  31.49 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  29.3 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  29.88 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  35 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  31.47 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  35 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  35 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  35.29 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.21 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  30.51 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  30.51 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  31.25 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  31.25 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  32.76 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  35.04 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  33.57 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  38.96 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  33.1 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  30.92 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  36.67 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  32.86 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  31.9 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  35.09 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  33.79 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  33.93 
 
 		 289 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.04 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  33.9 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  32.48 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  32.48 
 
 		 296 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  33.61 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  33.04 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  39.5 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  34.75 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  32.61 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  33.93 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  33.61 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  35.51 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.17 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>