More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4103 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  41.13 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  34.42 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  37.22 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  32.82 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  35.47 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  35.97 
 
 		 336 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  35.42 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  43.51 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  42.31 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  36.3 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  41.98 
 
 		 347 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  34.85 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  34.3 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  33.58 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  44.16 
 
 		 333 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  34.75 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  33.7 
 
 		 349 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  38.41 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  37.43 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  42.95 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  38.36 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  42.57 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  38.76 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  33.59 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  38.12 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  41.45 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  41.29 
 
 		 358 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  37.5 
 
 		 331 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  31.67 
 
 		 342 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  40.26 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  30.51 
 
 		 335 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  37.84 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  35.39 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  41.5 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  27.66 
 
 		 334 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  31.03 
 
 		 336 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  37.16 
 
 		 328 aa  93.2  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  30.98 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  31.6 
 
 		 334 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  32 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  40.14 
 
 		 332 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  36.18 
 
 		 347 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  37.32 
 
 		 350 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  34.67 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  30.2 
 
 		 348 aa  85.5  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.3 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  33.14 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  38.82 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  41.96 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  42.71 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  35.78 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  37.23 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  39.62 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  34.45 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  40.24 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  35.78 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  38.26 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  44.32 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  41.12 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  39.64 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  39.64 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  36.7 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  39.64 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  38.18 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  32.26 
 
 		 334 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  30.66 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  34.38 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  26.97 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  34.38 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  36.7 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  41.38 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  35.45 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  35.34 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  35.34 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  33.88 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  35.45 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  31.45 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  37.07 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  39.62 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  38.32 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3744  RC101  32.89 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.803465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  29.71 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  37.38 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  29.71 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  37.38 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  37.38 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  37.38 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2980  ParB-like chromosome partitioning protein  34.55 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  37.38 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  38.64 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  37.38 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  34.48 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  37.38 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  37.38 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  37.38 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  37.38 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  37.38 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>