273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4584 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  100 
 
 		 335 aa  679    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  60.36 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  58.38 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  53.98 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  54.95 
 
 		 333 aa  351  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  43.92 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  41.79 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  41.84 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  45.27 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  46.62 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  42.44 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  44.15 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  39.94 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  37.89 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  43.56 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  44.48 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  41.19 
 
 		 340 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  42.35 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  40.66 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  41.96 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  41.16 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  40.87 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  39.71 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  42.09 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  43.1 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  38.07 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  38.38 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  40.12 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  40.21 
 
 		 322 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  38.58 
 
 		 326 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  39.87 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  41.97 
 
 		 353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  33.33 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  36.28 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  37.67 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.79 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  38.26 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  36.55 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  40.23 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  38.75 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  39.26 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  37.18 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  35.21 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  33.44 
 
 		 334 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  35.79 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  33.88 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  40.45 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  34.42 
 
 		 274 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  42.54 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  40.72 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  36.94 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  36.94 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  28.64 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  30.25 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  27.03 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  30.72 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  37.27 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.39 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  29.47 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  26.81 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.8 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  29.41 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  33.33 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  29.49 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  27.27 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  29.11 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  30.26 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  35.45 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  35.65 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  35.45 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  29.61 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  33.86 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  33.86 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  27.27 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  27.75 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  28 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  31.55 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.24 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 607 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.24 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  29.17 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  33.96 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  35.58 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  29.26 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  41.3 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  20.83 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  28.76 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  32.5 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  32.5 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  24.39 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  28.5 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  34.62 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  32.95 
 
 		 572 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  28.32 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>