266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3104 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  100 
 
 
457 aa  910    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  82.08 
 
 
462 aa  578  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  80.55 
 
 
442 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  52.74 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  44.65 
 
 
483 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0719  ParB domain protein nuclease  36.73 
 
 
458 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.320952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  30.99 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  29.72 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  31.94 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  29.68 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  26.37 
 
 
298 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  30.35 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  25.91 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  30.86 
 
 
303 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  25.52 
 
 
294 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  25.91 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  28.57 
 
 
290 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  25.91 
 
 
297 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  25.91 
 
 
297 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0135  nuclease  42.71 
 
 
434 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00112116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  29.5 
 
 
272 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  28.81 
 
 
311 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  28.44 
 
 
290 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  28.14 
 
 
283 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  29.17 
 
 
304 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  31.21 
 
 
313 aa  63.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  29.19 
 
 
290 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  28.57 
 
 
290 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  28.57 
 
 
290 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  27.37 
 
 
293 aa  63.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  30.34 
 
 
289 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  29.22 
 
 
311 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  25.3 
 
 
286 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  31.21 
 
 
302 aa  63.2  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  26.47 
 
 
283 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  27.38 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  27.38 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  27.38 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3031  ParB domain protein nuclease  28.37 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  27.38 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  28.43 
 
 
293 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  27.38 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  27.38 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  27.38 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  27.38 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  28.39 
 
 
303 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  26.47 
 
 
283 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  25.93 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  27.2 
 
 
290 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 
306 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  26.86 
 
 
294 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  25.48 
 
 
305 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  26.77 
 
 
283 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  29.81 
 
 
294 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  28.77 
 
 
565 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  26.82 
 
 
296 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  31.28 
 
 
287 aa  61.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  35.51 
 
 
411 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  26.82 
 
 
292 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  26.77 
 
 
283 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  29.14 
 
 
572 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  31.67 
 
 
288 aa  60.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  31.49 
 
 
303 aa  60.1  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  26.77 
 
 
283 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  27.75 
 
 
293 aa  60.1  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  27.78 
 
 
290 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  26.77 
 
 
283 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  32.52 
 
 
291 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  26.82 
 
 
292 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  27.78 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  31.06 
 
 
322 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  27.07 
 
 
256 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  27.27 
 
 
597 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  28.57 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  26.36 
 
 
294 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  26.36 
 
 
292 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  27.98 
 
 
297 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  25.33 
 
 
272 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  28.65 
 
 
296 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  31.91 
 
 
298 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  28.57 
 
 
294 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  27.51 
 
 
294 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  26.32 
 
 
303 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  25.91 
 
 
292 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  27.07 
 
 
256 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  29.63 
 
 
288 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  29.63 
 
 
290 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  26.13 
 
 
294 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  26.89 
 
 
274 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  25.76 
 
 
283 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  25.76 
 
 
283 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  26.53 
 
 
292 aa  57  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  28.57 
 
 
290 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  25.87 
 
 
283 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  27.9 
 
 
294 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  34.02 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  27.93 
 
 
313 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  29.67 
 
 
282 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  25.6 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  25.28 
 
 
311 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>