226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0563 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  100 
 
 
462 aa  920    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  91.98 
 
 
442 aa  794    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  82.08 
 
 
457 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  52.31 
 
 
422 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  42.22 
 
 
483 aa  236  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0719  ParB domain protein nuclease  38.1 
 
 
458 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.320952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  28.25 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  28.83 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0135  nuclease  42.71 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00112116 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  29.35 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  24.9 
 
 
293 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  27.06 
 
 
272 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3031  ParB domain protein nuclease  30.23 
 
 
411 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  26.67 
 
 
283 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  29.6 
 
 
565 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  28.19 
 
 
289 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  26.98 
 
 
294 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  27.6 
 
 
298 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  24.02 
 
 
305 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  35.51 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  27.51 
 
 
290 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  28.93 
 
 
298 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  23.57 
 
 
286 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  31.47 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  24.78 
 
 
305 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  26.92 
 
 
283 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  23.91 
 
 
297 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  23.91 
 
 
297 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  23.91 
 
 
305 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  26.32 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  26.55 
 
 
263 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  26.55 
 
 
263 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  26.32 
 
 
290 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  24.49 
 
 
283 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  27.54 
 
 
293 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  27.71 
 
 
306 aa  57.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  26.32 
 
 
290 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  26.32 
 
 
290 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  26.32 
 
 
290 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  24.11 
 
 
293 aa  57.4  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  27.49 
 
 
294 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  25.31 
 
 
283 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  24.78 
 
 
295 aa  57  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  26.98 
 
 
304 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  27.33 
 
 
303 aa  57  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  27.54 
 
 
313 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  28.65 
 
 
282 aa  56.6  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  25.6 
 
 
283 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  25.84 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  29.66 
 
 
322 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  25.84 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  31.75 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  23.02 
 
 
294 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  25.4 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  25.84 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  25.84 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  25.84 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  25.84 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  25.84 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  25.6 
 
 
283 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  26.52 
 
 
279 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  23.64 
 
 
311 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  24.88 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.05 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  25.56 
 
 
597 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  24.19 
 
 
290 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  25.58 
 
 
290 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  29.58 
 
 
283 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  25.37 
 
 
272 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  25.6 
 
 
283 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.11 
 
 
421 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1535  ParB domain protein nuclease  39.71 
 
 
424 aa  54.3  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  27.06 
 
 
284 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  23.32 
 
 
293 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  27.49 
 
 
282 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  25.88 
 
 
297 aa  54.3  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  26.01 
 
 
269 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  24.74 
 
 
256 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  24.02 
 
 
294 aa  53.9  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  26.56 
 
 
294 aa  53.9  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  28.24 
 
 
314 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  35.09 
 
 
285 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  26.09 
 
 
311 aa  53.9  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  27.03 
 
 
572 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  25.58 
 
 
290 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  27.16 
 
 
296 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  26.37 
 
 
282 aa  53.5  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  37.21 
 
 
178 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  27.75 
 
 
287 aa  53.5  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  33.72 
 
 
177 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  25.65 
 
 
292 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  25.98 
 
 
286 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  27.08 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  26.02 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  25.93 
 
 
286 aa  52.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  30.4 
 
 
256 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  26.64 
 
 
290 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  27.03 
 
 
426 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  24.64 
 
 
283 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  23.43 
 
 
294 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>