More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0719 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0719  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 458 aa  910    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.320952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  48.21 
 
 		 483 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  37.99 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  36.24 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  37.67 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  37.57 
 
 		 462 aa  143  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  30.73 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  27.03 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  27.03 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  25.22 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  27.57 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2543  parB-like partition protein  33.78 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  30.77 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  26.95 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  25.41 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  30 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 355 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1535  ParB domain protein nuclease  25.82 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  32.48 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  29.41 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  24.31 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  28.96 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3558  parB-like partition protein  36 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  27.22 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  32.23 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  27.85 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  25.33 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  25.34 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  31.67 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  27.17 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  25.45 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  26.6 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  27.04 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  27.62 
 
 		 321 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  28.4 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  26.61 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  26.09 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  25.61 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  25.61 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  26.36 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  28.02 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  27.49 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  29.26 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  30.08 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  35.79 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  25.95 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  27.89 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  27.23 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  26.74 
 
 		 282 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  27.78 
 
 		 315 aa  57  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  25.13 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  27.78 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  26.94 
 
 		 292 aa  57  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  27.37 
 
 		 292 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  26.72 
 
 		 283 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  27.37 
 
 		 292 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  26.29 
 
 		 256 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  27.37 
 
 		 292 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  27.37 
 
 		 292 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  29.01 
 
 		 283 aa  57  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  27.73 
 
 		 282 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  33.64 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  35.56 
 
 		 298 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  27.78 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  24.5 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  31.78 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  24.73 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  27.16 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  29 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  33.71 
 
 		 305 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  26.69 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  27.59 
 
 		 283 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  26.87 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  25.11 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 298 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  24.41 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 298 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  31.78 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  24.62 
 
 		 293 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  27.16 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  25.11 
 
 		 268 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  26.37 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  24.86 
 
 		 296 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  27.2 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  27.09 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  27.09 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  27.55 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  27.57 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  30.13 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  28.92 
 
 		 597 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  28.32 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  27.66 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  27.18 
 
 		 282 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  32.23 
 
 		 301 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  25.26 
 
 		 294 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  25.26 
 
 		 292 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  27.85 
 
 		 565 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  27.04 
 
 		 281 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>