More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3558 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014214  Mesil_3558  parB-like partition protein  100 
 
 		 333 aa  677    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  39.78 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  42.06 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  48 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  34.55 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  46.67 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  37.6 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  44.59 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  46.58 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  47.22 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  43.24 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  44.59 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  43.24 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  48.57 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.11 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  44.59 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  43.24 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  41.77 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  44.59 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  44.59 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  47.95 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  46.15 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  44 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  37.75 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  40 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  49.33 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  38.39 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  29.29 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  36.08 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  32.65 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  41.03 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  46.15 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  47.95 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  46.91 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  46.15 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  43.24 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  35.51 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  40.66 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  44.29 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  39.77 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  32.14 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  34.88 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  41.67 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  46.91 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  36.43 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  36.59 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  42.73 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  41.33 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  46.97 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.85 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  33.77 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1670  parB-like partition protein  42.11 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.925128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  45.21 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  40 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  41.28 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  30.06 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  35.85 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  35.19 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  50 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  41.33 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  42.86 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  35.19 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.66 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  42.65 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.66 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.66 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  35.05 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  46.67 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  41.46 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  41.43 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  41.43 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  40.85 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.19 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  41.43 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  38.67 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  36.9 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  43.66 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  33.64 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  29.8 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  39.77 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5824  parB-like partition protein  46.27 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  41.43 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.18 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  43.84 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  39.73 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  44 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  33.64 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  42.47 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  33.91 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  43.75 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  45.12 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  46.58 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>