More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0002 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  100 
 
 		 315 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  42.48 
 
 		 349 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  42.53 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  41.94 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  41.37 
 
 		 333 aa  225  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  48.47 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  41.86 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  43.23 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  41.35 
 
 		 336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  43.82 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  40.67 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  40.53 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  38.08 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  38.38 
 
 		 335 aa  208  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  41.79 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  43.96 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  41.58 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  40.81 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  39 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  39.93 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  37.21 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  38.83 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  41.4 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  38.21 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  37.25 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  38.77 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  38.46 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  34.32 
 
 		 347 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  36.98 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  34.48 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  36.33 
 
 		 350 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  36.27 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  34.95 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  40.89 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  38.31 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  40 
 
 		 353 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  35.02 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  32.23 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  36.3 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  32.23 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  36.65 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  38.22 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  40.78 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  32.69 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  34.28 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  32.23 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  31.93 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  35.74 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  43.51 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  33.8 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  37.43 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  33.16 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  28.57 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  30.34 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  35.09 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  35.09 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.12 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  32.16 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  45.63 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.25 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  29.46 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  42.7 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  29.45 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  41.57 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  37.72 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  29.47 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  29.2 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  35.36 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  37.39 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  29.26 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  28 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  29.75 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  31.28 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  26.44 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  29.19 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  37.72 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  36.67 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  29.86 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  25.39 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  27.87 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  27.87 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  34.17 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  32.19 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  34.17 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  38.64 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  28.96 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  36.61 
 
 		 398 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  34.17 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  35.78 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  33.78 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  38.64 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  30.27 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  26.7 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  35 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  28.48 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>