273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4022 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  100 
 
 
316 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  38.82 
 
 
325 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  36.92 
 
 
333 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  35.01 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  36 
 
 
350 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  37.58 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  37.2 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  37.58 
 
 
331 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  36.02 
 
 
326 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  37.54 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  35.99 
 
 
333 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  37.54 
 
 
328 aa  189  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  36.63 
 
 
333 aa  188  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  36.26 
 
 
333 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  35.2 
 
 
339 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  35.33 
 
 
347 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  35 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  36.75 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  39.09 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  37.59 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  34.4 
 
 
336 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  34.52 
 
 
335 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  37.75 
 
 
351 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  33.92 
 
 
331 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  41.54 
 
 
360 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  36.64 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  36.11 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  37.77 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  36.26 
 
 
334 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  35.42 
 
 
325 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  38.87 
 
 
322 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  37.59 
 
 
358 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  35.45 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  34.85 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  34.69 
 
 
348 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  40.15 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  39.63 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  33.13 
 
 
329 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  35.38 
 
 
353 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  39.56 
 
 
343 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  33.23 
 
 
329 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  38.2 
 
 
345 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  35.15 
 
 
328 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  35.4 
 
 
334 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  32.84 
 
 
326 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  34.63 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  30.36 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  30.1 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  42.54 
 
 
338 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  33.58 
 
 
274 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  27.24 
 
 
345 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  23.08 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  22.67 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  21.32 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  37.8 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  37.12 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  38.2 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  27.34 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  28.57 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  31.47 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  28.49 
 
 
607 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  33.1 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  35.14 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  31.49 
 
 
294 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  32.76 
 
 
391 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  34.15 
 
 
319 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  31.94 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  31.94 
 
 
290 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  34.83 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  34.83 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  29.37 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  38.14 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  41.77 
 
 
572 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  30.3 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  30.51 
 
 
668 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  27.86 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  31.01 
 
 
295 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  27.86 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  39.39 
 
 
283 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  30.66 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  30 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  32.2 
 
 
359 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2980  ParB-like chromosome partitioning protein  35.66 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  36.61 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  36.61 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  30.16 
 
 
213 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  41.67 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  36.78 
 
 
293 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  29.51 
 
 
299 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  32.21 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  30.37 
 
 
362 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  30.23 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  30.23 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  31.43 
 
 
256 aa  52  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  35.58 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  30.23 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  30.23 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  34.65 
 
 
297 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.24 
 
 
321 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  30.23 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>