237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3275 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  100 
 
 		 322 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  44.97 
 
 		 351 aa  225  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  48.19 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  43.71 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  42.09 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  43.48 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  41.81 
 
 		 350 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  40.86 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  40.21 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  47.08 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  42.86 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  40.43 
 
 		 340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  40.26 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  39.3 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  39.41 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  42.2 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  43.27 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  44.71 
 
 		 337 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  44.4 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  42.86 
 
 		 347 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  39.81 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  39.52 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  44.53 
 
 		 358 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  39.6 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  40.68 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  44.3 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  40.86 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  41.64 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  44.58 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  40.07 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  46.09 
 
 		 345 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  41.81 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  41.81 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  49.49 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  40.89 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  38.78 
 
 		 360 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  38.76 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  41.87 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  37.4 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  37.74 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  38.67 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  40.91 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.36 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  39.29 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  33.61 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  36.26 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  31.15 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  37.14 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  35.33 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  34.67 
 
 		 274 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  35.03 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  38.37 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  26.62 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  30.34 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  25.19 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  27.7 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  36.36 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  29.48 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  34.86 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  32.77 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  23.85 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  30.36 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  33.99 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  33.99 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  33.94 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  42.35 
 
 		 597 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  29.63 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  25.65 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  31.91 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  27.7 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  35.46 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  31.65 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  31.18 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  35.43 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  30.46 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  32.29 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  31.65 
 
 		 361 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  32.41 
 
 		 292 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  27.19 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  30.58 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  30.58 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  37.08 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  33.01 
 
 		 291 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  30.41 
 
 		 288 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  30.41 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  32.38 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.41 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  28.35 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  35.78 
 
 		 572 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  25.58 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  39.47 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  25.58 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  29.71 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  40 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  27.82 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  38.61 
 
 		 565 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  40 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>