294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5913 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 336 aa  661    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  67.76 
 
 		 334 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  52.63 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  46.64 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  44.17 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  43.82 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  41.45 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  43.28 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  40.15 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  40.81 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  45.86 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  42.54 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  40.46 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  42.65 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  39.78 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  39.53 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  41.7 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  40.2 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  40.52 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  42.54 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  40.44 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  42.91 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  40.53 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  37.18 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  35.13 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  39.26 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  37.82 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  36.7 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  37.63 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  33.05 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  37.89 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  38.66 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  40.23 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  37.55 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  34.19 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.42 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.1 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  35.33 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  35.33 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  36.12 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  37 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  35.32 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  36.67 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  36.92 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  34.07 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  32.62 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  39.77 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  38.24 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  31.06 
 
 		 274 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  31.4 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  32.89 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  30.58 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  32.77 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  32.77 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.36 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  38.18 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  30.11 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  38.18 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  38.18 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  38.18 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  38.18 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  38.18 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  38.18 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  31.75 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  31.55 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  35.46 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  37.27 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  37.27 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  37.27 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  31.72 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  33.87 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  33.59 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  36.79 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  41.67 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  30.32 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  35.25 
 
 		 605 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  32.5 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  26.78 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  30.86 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  32.46 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.76 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  26.59 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  38.53 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  38.61 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  31.71 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 268 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  40 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  39.74 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  30.19 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  30.3 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  27.41 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  38.19 
 
 		 549 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  31.32 
 
 		 321 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  27.76 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>