240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4544 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  100 
 
 		 336 aa  683    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  42.99 
 
 		 333 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  43.56 
 
 		 335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  42.73 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  39.88 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  39.04 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  37.34 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  45.27 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  40.92 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  37.39 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  38.15 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  42.27 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  42.19 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  38.72 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  39.17 
 
 		 333 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  37.92 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  37.92 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  41.39 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  38.61 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  40 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  36.14 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  39.29 
 
 		 329 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  41.75 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  38.8 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  37.46 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  37.21 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  40.64 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  38.37 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  42.55 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  40.86 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  37.33 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  35.74 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  41.69 
 
 		 353 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  38.85 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  44.3 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  35.08 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  36.21 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  36.56 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  35.34 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  33.54 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  34.19 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  36.84 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  31.94 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  36.18 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  32.92 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  37.68 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.75 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  31.74 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  40.36 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  34.75 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  35.37 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  35.29 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  41.3 
 
 		 668 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  38.41 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  38.41 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  44.05 
 
 		 597 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  32.06 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  33.88 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  42.86 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  35.98 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  32 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  35.54 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  38.36 
 
 		 607 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  32.06 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  32.2 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  31.02 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  35.64 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  37.04 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  28.91 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  30.83 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  28.91 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  31.48 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  31.45 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39.6 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  31.98 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  23.91 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  26.99 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  31.89 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  25.66 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  30.91 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  34.44 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  30.25 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  28.07 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  35.46 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  32.61 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  31.15 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  37.62 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.42 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  38.14 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  35.04 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  33.04 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  34.75 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  25.22 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.5 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  29.66 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  34.29 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  35.42 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  34.69 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>