More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4533 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  100 
 
 		 326 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  50.76 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  35.87 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  37.22 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  36.14 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  36.63 
 
 		 336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  37.73 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  34.57 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  34.06 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  37.73 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  34.8 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  34.59 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  34.36 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  33.43 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  32.47 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  37.28 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  33.46 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  31.47 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  31.37 
 
 		 348 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  32.23 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  40.38 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  35.46 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  34.67 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  32.94 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  30.52 
 
 		 347 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  29.68 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  31.9 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  32.84 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  33.81 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  29.79 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  30.54 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  33.81 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  37.04 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  30.3 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  34.16 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  34.75 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  30.88 
 
 		 358 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  30.9 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  33.59 
 
 		 360 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  29.13 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  31.16 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  30.92 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  29.88 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  34.36 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  39.16 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  39.08 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  30.9 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  27.3 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  34.3 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  31.07 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  34.12 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  31.9 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  35.33 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  32.14 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  28.65 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  29.47 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  29.78 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  32.32 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  31.47 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  32.65 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  28.86 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  30.2 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  28.86 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  34.03 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  29.61 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  30.32 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  35.56 
 
 		 605 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  32.24 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  32.09 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  31.91 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  29.08 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  29.61 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  33.11 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  31.13 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  31.13 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  29.05 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  29.95 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  29.05 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  29.05 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  29.08 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  30.41 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  33.59 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  34.72 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  32.24 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  34.72 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  34.72 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  30.34 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  29.05 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  27.67 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  38.32 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  31.58 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  33.1 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  30.34 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>