More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3562 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 353 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  50.34 
 
 		 333 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  46.05 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  47.88 
 
 		 334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  49 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  50.51 
 
 		 349 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  41.67 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  42.41 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  47.54 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  40.95 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  45.09 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  39.87 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  44.06 
 
 		 360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 335 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  41.28 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  41.49 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  43.28 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  41.97 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  41.95 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  38.72 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  46.49 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  40.96 
 
 		 325 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  39.46 
 
 		 342 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  48.54 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  52.4 
 
 		 329 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  40.84 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  43.22 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  40.51 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  40.82 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  37.79 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  37.22 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  35.44 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  35.44 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  36.51 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  35.95 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  39.13 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  37.95 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  41.49 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  37.79 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  36.94 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  33.22 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  34.7 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  34.06 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  33.01 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  35.24 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  30 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  29.36 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  39.44 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  34.54 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  35.21 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  35.17 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  35.92 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  28.47 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  31.94 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  32.28 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  26.38 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  33.92 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  31.25 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  26.38 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  30.16 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  33.86 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  36.7 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  34.75 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.43 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  31.58 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  30.08 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  34.43 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  34.43 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  32.77 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  29.78 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  25 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  35.04 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  27.8 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  39.05 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  30.41 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  31.4 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  30.63 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  30.63 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  30.57 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  31.43 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  28.84 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  28.38 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  32.43 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  30.51 
 
 		 278 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  35.04 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  28.85 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  26.61 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  38.54 
 
 		 668 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  35.11 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  33.11 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  31.75 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  25 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  33.85 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>