176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4710 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  100 
 
 		 335 aa  685    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  54.41 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  36.56 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  36.27 
 
 		 347 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  34.46 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  35.79 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  32.36 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  33.12 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  32.36 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  33.44 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  33.01 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  34.56 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  34.01 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  35.09 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  35.27 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  31.93 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  31.65 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  35.19 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  32.98 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  33.45 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  28.91 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  33.58 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  30.64 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  33.21 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  33.45 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  32.88 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  30.42 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  34.04 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  34.64 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  30.94 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  30.94 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  32.48 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  33.63 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  29.97 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  27.62 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  29.72 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  28.82 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  31.63 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  30.91 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  31.43 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  31.15 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  26.73 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  30.34 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  31.64 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  29.11 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  30.9 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  34.95 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  31.44 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  30.51 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  32.6 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  40.66 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  29.79 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  40.66 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  25.84 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  28.57 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  31.28 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  28.49 
 
 		 668 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  32.73 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  30.63 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  27.37 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  30.32 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  29.53 
 
 		 607 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  32.05 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  33.09 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  30.32 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  32.35 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 294 aa  52.8  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  30.46 
 
 		 297 aa  52.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  26.8 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  26.95 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  28.83 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  29.22 
 
 		 283 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  32.03 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.15 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  26.63 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  28.35 
 
 		 304 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  29.14 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3690  nuclease  52.27 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  24.78 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  26.91 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  28.22 
 
 		 283 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  28.83 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  28.83 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  34.74 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  28.83 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  25.95 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  31.54 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  34.74 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  28.4 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  30.82 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  30.2 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  28.22 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5971  parB-like partition proteins  29.41 
 
 		 552 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  37.61 
 
 		 605 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  28.83 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>