More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4823 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  100 
 
 
325 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  60.47 
 
 
337 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  60.94 
 
 
340 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  44.35 
 
 
348 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  42.31 
 
 
339 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  41.96 
 
 
335 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  40.91 
 
 
333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  39.82 
 
 
333 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  40.12 
 
 
333 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  37.95 
 
 
333 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  38.26 
 
 
347 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  40.2 
 
 
349 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  40.12 
 
 
336 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  40.2 
 
 
351 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  39.6 
 
 
322 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  38.83 
 
 
315 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  37.95 
 
 
347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  35.35 
 
 
335 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  37.24 
 
 
331 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  37.06 
 
 
322 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  38.1 
 
 
336 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  36.39 
 
 
325 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  39.49 
 
 
329 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  38.14 
 
 
342 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  38.49 
 
 
329 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  36.12 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  35.16 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  35.56 
 
 
332 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  36.7 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  36.14 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  34.51 
 
 
326 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  36.7 
 
 
334 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  35.79 
 
 
328 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  34.2 
 
 
350 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  38.35 
 
 
360 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  34.66 
 
 
358 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  32.13 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.91 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  32.04 
 
 
331 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  37.41 
 
 
353 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  34.98 
 
 
343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  31.52 
 
 
345 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  31.48 
 
 
312 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  30 
 
 
326 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  30.21 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  34.64 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  31.49 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  32.75 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  32.82 
 
 
274 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  37.5 
 
 
328 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  36.56 
 
 
338 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  39.84 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  41.12 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  31.56 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  35.2 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  30.2 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  45.68 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  36.59 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  33.33 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  33.12 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  33.12 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.71 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  36.75 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  26.14 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  33.12 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  38.71 
 
 
392 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  33.8 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  33.12 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  28.84 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  34.68 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  36.75 
 
 
301 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  27.13 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  42.03 
 
 
359 aa  56.6  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  34.53 
 
 
398 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  39.24 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  37.86 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  34.96 
 
 
289 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  33.12 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  33.12 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  33.12 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  33.12 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  33.12 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  29.93 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  33.33 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  33.12 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  33.12 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  33.1 
 
 
283 aa  56.2  0.0000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  29.63 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.17 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  30.1 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  26.74 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  33.33 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  36 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  30.91 
 
 
378 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  32.31 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  32.5 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  32.85 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  35.92 
 
 
572 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  36.3 
 
 
391 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>