More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3888 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  100 
 
 		 369 aa  728    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  36.09 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  38.05 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  34.23 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.37 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  36.44 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  36.3 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  35.95 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  30.77 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  27.7 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  30.73 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  34.53 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  30.83 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  36.75 
 
 		 597 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  33.6 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  34.93 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  33.56 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  31.63 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  30 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  29.65 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  36.44 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  28.19 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  31.37 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.09 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  27.2 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  31.4 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  29.9 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  29.71 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  31.52 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  35.46 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  28.38 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  30.47 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  35.62 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  37.86 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  32.76 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  33.57 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  30 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  38.24 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  36.3 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  28.34 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  32.5 
 
 		 289 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  31.52 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  28.06 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  32 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  26.62 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  30.87 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  28.03 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  30.04 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  29.93 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  32 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  27.48 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  33.57 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  24.83 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  30.77 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  27.75 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  31.18 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  31.79 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  30.99 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  36.89 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  30.07 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  29.11 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  30.67 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.5 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  31.88 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  32.5 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  32.5 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  32.5 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  32.5 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  27.27 
 
 		 294 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  29.53 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  32.5 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  30.19 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  32.21 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  35.62 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  32.5 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  26.53 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  32.5 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  30.34 
 
 		 279 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  32.2 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  28.17 
 
 		 293 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  29.13 
 
 		 299 aa  53.5  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  32.06 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  28.83 
 
 		 287 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  32.06 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  33.06 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 298 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 300 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  30.3 
 
 		 278 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  32.23 
 
 		 293 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  31.67 
 
 		 290 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  27.27 
 
 		 306 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  31.67 
 
 		 290 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  30.56 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>