More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0077 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  100 
 
 		 335 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  42.8 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  42.53 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  39.1 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  25 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  24.92 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  28.09 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  33.8 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  29.08 
 
 		 254 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  26.81 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  25.95 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  24.01 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  32.32 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  30.2 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  30.11 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  33.6 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  30 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  33.08 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  36.14 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  30.53 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  28.64 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  36.5 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  36.5 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  36.5 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  36.5 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  37.23 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  36.5 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  32.8 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  32.91 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  36.5 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  36.43 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  36.5 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  36.5 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  31.86 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  32.03 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.66 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  27.32 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  36.36 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  31.75 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  33.81 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  29.94 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  30.91 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  31.15 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  34.31 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  27.2 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  36.5 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  30.41 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  27.15 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  34.13 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.89 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  31.06 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  29.55 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.89 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  34.55 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  29.95 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  32.84 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  26.69 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  30.32 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  35.34 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  34.59 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  30.66 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  30 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  32.88 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  30.72 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  31.85 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  32.08 
 
 		 347 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  29.55 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  27.51 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  31.28 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  26.14 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  30.09 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  35.48 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  32.35 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  31.45 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  28.14 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  33.93 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  29.39 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  35.11 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  30.09 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  29.63 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  30.09 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  30.09 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  27.8 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  30.81 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  26.12 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  31.53 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  31.86 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  30.92 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>