26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_41 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  100 
 
 		 335 aa  681    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  35.23 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  34.27 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  38.34 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  33.33 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  27.36 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  31.79 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  31.21 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  31.21 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  31.21 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  29.28 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  32.42 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  32.76 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  36.36 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  30.13 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  32.2 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  28.04 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  28.57 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  28.36 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  27.27 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  27.61 
 
 		 365 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.6 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  26.21 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  29.09 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>