32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0021 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  100 
 
 
323 aa  659    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  100 
 
 
323 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  96.58 
 
 
323 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  89.44 
 
 
323 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  62.81 
 
 
322 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  49.07 
 
 
321 aa  289  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  30.36 
 
 
323 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  31.82 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  31.31 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  30.92 
 
 
324 aa  92.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  27.49 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  30.38 
 
 
382 aa  89.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  29.65 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  26.37 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  35.88 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  35.62 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  28.57 
 
 
327 aa  63.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  29 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  31.94 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  27.85 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  27.63 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  29.88 
 
 
337 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  26.49 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  31.82 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  28.37 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  28.37 
 
 
365 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  28.35 
 
 
364 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  23.27 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  28.74 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  26.98 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  31.82 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  30.77 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>