29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4251 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  100 
 
 
322 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  63.35 
 
 
323 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  64.38 
 
 
323 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  63.12 
 
 
323 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  63.12 
 
 
323 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  47.38 
 
 
321 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  30.77 
 
 
324 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  32.02 
 
 
324 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  29.86 
 
 
323 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  29.93 
 
 
324 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  29.88 
 
 
382 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  31.79 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  29.55 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  27.5 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  33.14 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  25.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  33.92 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  27.75 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  27.43 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  28.33 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  22.7 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  26.99 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  28.02 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  26.5 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  28.1 
 
 
357 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  37.36 
 
 
365 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  27.27 
 
 
364 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  22.89 
 
 
337 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  25.85 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>