243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4954 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  100 
 
 		 324 aa  663    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  70.68 
 
 		 327 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  40.99 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  40.78 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  41.25 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  39.76 
 
 		 254 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  42.13 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  29.46 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  31.21 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  26.37 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  27.34 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  28.22 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  29.27 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  29.27 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  29.27 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  34.38 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  27.78 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  28.09 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  28.64 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  28.29 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  33.58 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.85 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  31.9 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  37.29 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  28.42 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  27.75 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  33.91 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.61 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  32.61 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  31.06 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.61 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.61 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  26.67 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  32.61 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  32.61 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  30.24 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  32.61 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  32.61 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  32.61 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  31.29 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  26.37 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  26.64 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  29.94 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  26.53 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  27.13 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  28.76 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  27.27 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  28.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  31.88 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  25.68 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  31.43 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  31.09 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  25.89 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  25.34 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  29.5 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  29.63 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  27.16 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  25.74 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  27.23 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  28.02 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  31.71 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  30.7 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  28.19 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  24.76 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  25.23 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  28.83 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  30.7 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  30.7 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  31.9 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  32.46 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  26.32 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  34.19 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  26.15 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  28.33 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.58 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  27.47 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  28.04 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  24.91 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  27.12 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  26.58 
 
 		 298 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  29.17 
 
 		 296 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  32.17 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  30.77 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  28.02 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  26.63 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  27.57 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  24.83 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  24.07 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  28.42 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  25.96 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  28.65 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  26.54 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  28.11 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>