More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7203 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  100 
 
 		 321 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  46.72 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  37.87 
 
 		 335 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  43.81 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  40.41 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  37.56 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  33.57 
 
 		 361 aa  85.9  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  27.65 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  27.19 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  38.78 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  27.68 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  33.33 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  32.2 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  36 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  33.18 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  31.02 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  34.62 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  36.64 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  31.94 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  28.57 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  32.21 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  33.7 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  32.12 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  33.11 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  31.35 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  31.91 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  30.81 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  27.84 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  29.68 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  37.04 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.21 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.21 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  30.19 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  32.16 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  33.83 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  28.77 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  34.81 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  32.12 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  28.33 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  32.31 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  38.21 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  34.31 
 
 		 605 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  34.81 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  30.59 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  28.29 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  32.9 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  31.02 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  33.11 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6316  chromosome partitioning protein ParB  28.29 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  34.59 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  32.67 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  30.88 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  30.26 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  32.74 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  33.55 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  34 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  32.64 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  32.78 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  31.06 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7548  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  33.11 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  33.11 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  33.11 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  28.57 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  29.74 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  32.41 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  29.74 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  35.33 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  32.65 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  29.26 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  32.18 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  31.33 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  30.96 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  28.5 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  31.28 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  33.11 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.93 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  27.98 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  29.47 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  29.12 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  31.65 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  24.81 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  31.91 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  34.42 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  34.33 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  29.1 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  31.68 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>