More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7548 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7548  parB-like partition protein  100 
 
 		 325 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  55.73 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  51.69 
 
 		 323 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  49.53 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  46.53 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  43.92 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  49.55 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  40.69 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  37.3 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  38.59 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  36.84 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  40.56 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  43.65 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  36.26 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  43.8 
 
 		 297 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  34.44 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  34.44 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  32.02 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  36.31 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.36 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  38.52 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  32.4 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  33.89 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  29.32 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  33.52 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36.62 
 
 		 283 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  37.42 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  31.46 
 
 		 286 aa  99.4  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  41.78 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  38.85 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  41.48 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  39.86 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  42.66 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  37.16 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  39.57 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  43.8 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  32.2 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  35.16 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  36.16 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 472 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  36.42 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  32.2 
 
 		 256 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  35.87 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  36.84 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  42.48 
 
 		 304 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  36.6 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  34.62 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  34.32 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  39.16 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  36.13 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  36.05 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  34.62 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  36.31 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  36 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  35.92 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  36.55 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  35.42 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  41.22 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  41.3 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  32.56 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  36.69 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  43.24 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.19 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  35.67 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  38.97 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2844  parB-like partition protein  47.96 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  36.08 
 
 		 290 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  39.16 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  40.27 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  46.08 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  35.66 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  36.08 
 
 		 288 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  30.53 
 
 		 293 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  34.67 
 
 		 529 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  35.85 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  34.62 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  31.22 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  34.5 
 
 		 375 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  37.41 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  39.44 
 
 		 268 aa  93.6  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  35.06 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  37.06 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  31.94 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  38.31 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  37.41 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  37.41 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  35.17 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1059  parB-like partition proteins  33.65 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>