More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6053 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 326 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  47.85 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  49.19 
 
 		 347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  48.16 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  48.16 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  47.19 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  47.63 
 
 		 312 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  45 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  40.31 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  40.52 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  39.14 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  41.98 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  38.58 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  41.69 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  38.58 
 
 		 335 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  41.16 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  38.1 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  35.94 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  39.2 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  35.82 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  40.82 
 
 		 351 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  36.02 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  39 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  39.57 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  39.15 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.08 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  37.46 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  34.08 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  39.55 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  37.4 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  39.18 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  37.55 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  37.93 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  35.02 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  33.84 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  35.41 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  38.77 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  34.65 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  33.76 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  34.67 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  33.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  32.89 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  31.16 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  29.02 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  29.72 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  28.1 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  29.62 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  40.72 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  37.79 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  40.26 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  29.52 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  28.51 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  29.9 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  34.23 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  37.25 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  34.01 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  30.77 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  28.21 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  26.77 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  38.38 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  26.17 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  30.23 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  26.17 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  32.58 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  30.04 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  24.38 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  34 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  28.48 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.89 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  31.43 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  28.21 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  36.21 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  23.43 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  25 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  23.75 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  31.88 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  33.04 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  33.62 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  35.2 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  32.39 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  30.53 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  32.33 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  32.33 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  30.67 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  33.06 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  31.67 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  30.53 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  30.53 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  28.46 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  31.67 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  28.46 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  25.48 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  30.53 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  38.2 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  30.53 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>