245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4518 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  100 
 
 		 339 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  50.63 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  45.22 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  43.92 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  44.88 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  45.39 
 
 		 333 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  44.69 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  47.26 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  48.48 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  42.81 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  45.79 
 
 		 349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  43.03 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  42.77 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  43.29 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  38.78 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  42.25 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  45.19 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  43.77 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  40.59 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  40.92 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  40.52 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  41.94 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  42.45 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  42.14 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  40.53 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  44.13 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  37.21 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  37.13 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  39.32 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  39.67 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  41.7 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  39.93 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  39.55 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  43.27 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  36.65 
 
 		 331 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  41.5 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  40.6 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  40.53 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  40.88 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.35 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  36.93 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  38.97 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  36.58 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  34.04 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  31.47 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  35.27 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  32.01 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  38.89 
 
 		 332 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  31.62 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  40.35 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  37.43 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  33.8 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  31.91 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  34.52 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.38 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  33.77 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  31.63 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  38.81 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  34.88 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  34.17 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.66 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  32.52 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  26.24 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  29.73 
 
 		 605 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  32.14 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 572 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  29.9 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  33.56 
 
 		 292 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  29.05 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  25.79 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  31.76 
 
 		 283 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  32.19 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  31.86 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  35.66 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  45.95 
 
 		 565 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  32.19 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  32.19 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  35.66 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  33.88 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  33.88 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  32.19 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  33.88 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  33.88 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  33.88 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  33.88 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  38.36 
 
 		 607 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  34.07 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  30.71 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  32.19 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  32.19 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  32.14 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  31.51 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5568  parB-like partition protein  29.1 
 
 		 552 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  28.43 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5971  parB-like partition proteins  29.1 
 
 		 552 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  33.88 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  33.88 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  32.61 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  33.88 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>