209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4455 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  100 
 
 
328 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  83.79 
 
 
328 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  83.79 
 
 
328 aa  567  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  47.85 
 
 
326 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  44.28 
 
 
347 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  48.05 
 
 
322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  44.61 
 
 
350 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  43.62 
 
 
331 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  43.56 
 
 
312 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  39.71 
 
 
335 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  41.4 
 
 
347 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  39.42 
 
 
345 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  42.5 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  40.53 
 
 
339 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  38.61 
 
 
336 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  38.86 
 
 
331 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  37.03 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  40.33 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  36.56 
 
 
331 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  37.2 
 
 
316 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  38.08 
 
 
349 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  36.98 
 
 
333 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  36.49 
 
 
333 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  33.64 
 
 
332 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  33.23 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  37.88 
 
 
360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  35.05 
 
 
329 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  34.24 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  34.64 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  37.42 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  38.49 
 
 
334 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  35.65 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  37 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  38.76 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  37.67 
 
 
325 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  37.91 
 
 
337 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  32.14 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  35.87 
 
 
340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  36.12 
 
 
336 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  40.78 
 
 
315 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  36.23 
 
 
353 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  33.01 
 
 
335 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  37.28 
 
 
326 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  41.58 
 
 
343 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  34.46 
 
 
342 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  34.28 
 
 
334 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  30.24 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  33.33 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  31.35 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  29.55 
 
 
338 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  30.98 
 
 
274 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.18 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  31.78 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5568  parB-like partition protein  32.39 
 
 
552 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5971  parB-like partition proteins  32.39 
 
 
552 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  27.27 
 
 
345 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  41.3 
 
 
296 aa  56.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  38.96 
 
 
607 aa  55.8  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  31.53 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  30.46 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  34.26 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  34.26 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  29.58 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  27.96 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  31.79 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  38.71 
 
 
549 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  27.42 
 
 
334 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  43.37 
 
 
362 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  30.77 
 
 
360 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  37.39 
 
 
359 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  33.33 
 
 
290 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  36.54 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  30.47 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  34.72 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  33.33 
 
 
288 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  29.6 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  30.17 
 
 
597 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  37.84 
 
 
572 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  30.87 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  34.81 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.26 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  29.69 
 
 
341 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  31.89 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  32.2 
 
 
571 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  32.2 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  35 
 
 
605 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3744  RC101  30 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.803465  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  42.39 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  34.48 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.78 
 
 
290 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 
290 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 
290 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 
290 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 
290 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 
290 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  31.82 
 
 
363 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  36.73 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 
290 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.78 
 
 
290 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  27.07 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>