More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5971 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5568  parB-like partition protein  100 
 
 		 552 aa  1086    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5971  parB-like partition proteins  100 
 
 		 552 aa  1086    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5527  ParB-like partition protein  63.86 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  35.59 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  27.86 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  28.94 
 
 		 281 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  33.87 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  30 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  28.33 
 
 		 278 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  26.89 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  34.66 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  30.54 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  33.94 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  27.03 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  26.69 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  30.39 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  29.81 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  28.02 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  32.77 
 
 		 605 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  28.8 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  29.12 
 
 		 298 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  33.7 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  33.7 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  30.9 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  29.53 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5579  putative plasmid partitioning protein  36.9 
 
 		 278 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  28.8 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  27.05 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3306  parB-like partition protein  30.38 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  32.98 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  29.33 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  31.72 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  31.25 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  26.8 
 
 		 289 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  29.69 
 
 		 299 aa  63.2  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  25.94 
 
 		 303 aa  62.8  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  28.92 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  28.37 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  26.92 
 
 		 255 aa  62.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  27.81 
 
 		 294 aa  62  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  29.65 
 
 		 268 aa  62  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  30.57 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  30.57 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.41 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.75 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  32.75 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.75 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.75 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  29.59 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  37.19 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  30.05 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  32.51 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  31.87 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  29.07 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  27.73 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  24.68 
 
 		 290 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  28.37 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  34.01 
 
 		 318 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  38.94 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0177  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000490694  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  24.26 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  30.13 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  27.49 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  27.49 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  29.24 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  29.89 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  31.95 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  24.26 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  27.49 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  32.39 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  28.3 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  26.09 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  32.82 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  27.49 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  30.99 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  27.32 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  23.61 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  32.16 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  31.25 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  31.93 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  27.49 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  32.16 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  35 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  35.59 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  32.16 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1762  parB-like partition protein  39.62 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  32.16 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  28.65 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  32.16 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  32.16 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  32.16 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>