More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5527 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5527  ParB-like partition protein  100 
 
 
556 aa  1105    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255225  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5568  parB-like partition protein  64.16 
 
 
552 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5971  parB-like partition proteins  64.16 
 
 
552 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  33.33 
 
 
272 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.02 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  36.56 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  33.17 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  35.14 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  35.14 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  35.14 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.87 
 
 
269 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  33.64 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  30.87 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  30.73 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  30.88 
 
 
278 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  31.88 
 
 
274 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  30.73 
 
 
279 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  30.73 
 
 
299 aa  70.1  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  29.12 
 
 
297 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  34.66 
 
 
298 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1762  parB-like partition protein  33.91 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  28.26 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  27.32 
 
 
282 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  29.27 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  34.78 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  34.78 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  32.37 
 
 
288 aa  67  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  28.8 
 
 
298 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  33.65 
 
 
304 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  34.71 
 
 
362 aa  64.3  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  34.3 
 
 
292 aa  64.3  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  26.32 
 
 
293 aa  64.3  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  29.07 
 
 
321 aa  64.3  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  31.95 
 
 
295 aa  63.9  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  32.96 
 
 
326 aa  63.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  32.65 
 
 
668 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  35.71 
 
 
296 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  26.17 
 
 
289 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  31.68 
 
 
295 aa  62.4  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  33.14 
 
 
294 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  27.31 
 
 
294 aa  62  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.49 
 
 
290 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  30.41 
 
 
281 aa  61.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  29.94 
 
 
281 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  33.88 
 
 
317 aa  61.2  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  27.62 
 
 
289 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  28.07 
 
 
290 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  29.67 
 
 
278 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  29.24 
 
 
281 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  28.23 
 
 
296 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  27.87 
 
 
257 aa  60.1  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  29.63 
 
 
280 aa  59.7  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  28.07 
 
 
290 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  28.07 
 
 
290 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  28.07 
 
 
290 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  28.07 
 
 
290 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  25.62 
 
 
289 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  26.04 
 
 
278 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  28.07 
 
 
290 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  32.52 
 
 
288 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  28.07 
 
 
290 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  32.63 
 
 
315 aa  60.1  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  35.29 
 
 
281 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  26.04 
 
 
278 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5579  putative plasmid partitioning protein  35.29 
 
 
278 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  34.24 
 
 
309 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  30.9 
 
 
605 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  33.7 
 
 
333 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  30.94 
 
 
279 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  32.23 
 
 
309 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3306  parB-like partition protein  29.38 
 
 
449 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  32.52 
 
 
290 aa  59.3  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  28.06 
 
 
284 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  30.95 
 
 
305 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  26.45 
 
 
303 aa  58.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  31.77 
 
 
297 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  28.9 
 
 
268 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  27.49 
 
 
290 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  27.49 
 
 
290 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  30.16 
 
 
284 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  30.73 
 
 
306 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  30.54 
 
 
314 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  29.61 
 
 
286 aa  57.4  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  29.91 
 
 
392 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  27.45 
 
 
282 aa  57.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  30.1 
 
 
305 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  30.7 
 
 
314 aa  57.4  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  25.91 
 
 
294 aa  57  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  30.18 
 
 
294 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  32.91 
 
 
367 aa  57  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  27.8 
 
 
285 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  37.5 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  27.91 
 
 
290 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  31.31 
 
 
314 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  30.21 
 
 
367 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  33 
 
 
297 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  28.93 
 
 
350 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  29.44 
 
 
292 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  28.51 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  32.69 
 
 
295 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>