More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3306 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3306  parB-like partition protein  100 
 
 		 449 aa  923    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  39.46 
 
 		 336 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  31.75 
 
 		 278 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.76 
 
 		 274 aa  90.5  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  33.55 
 
 		 268 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 281 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  34.21 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  31.71 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  34.84 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 272 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  31.58 
 
 		 288 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  33.53 
 
 		 286 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  33.53 
 
 		 286 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  33.55 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  29.03 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  31.17 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  31.17 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  32.9 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  34.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  34.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  34.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  34.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  34.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  34.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  34.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  30.69 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  33.55 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  33.55 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  27.75 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  33.55 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  31.41 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  34.21 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  33.55 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  32.91 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  33.55 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  33.55 
 
 		 295 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  32.48 
 
 		 293 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  30.92 
 
 		 668 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  30.72 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  29.49 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  30.57 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  31.21 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  24.91 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  30.95 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  32.9 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  32.48 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  32.48 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  32.52 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  37.65 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  31.85 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  31.85 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  34.03 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  34.03 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  31.58 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  34.03 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  32.73 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  32.68 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  31.85 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  33.54 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  31.85 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  34.87 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  31.85 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  33.54 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  32.48 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  31.21 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  33.55 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  29.38 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  36.29 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  30.06 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3186  parB-like partition protein  28.85 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000842796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  27.66 
 
 		 280 aa  76.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  30.73 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  35.2 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  29.68 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  30.87 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  30 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  24.81 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  31.07 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  32.26 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  28.85 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  27.1 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  28.36 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  31.21 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  34.65 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>