More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0177 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0177  parB-like partition protein  100 
 
 
350 aa  698    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000490694  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  61.13 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2543  parB-like partition protein  59.78 
 
 
358 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3186  parB-like partition protein  56.81 
 
 
350 aa  355  6.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000842796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  36.18 
 
 
279 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  34.62 
 
 
290 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  37.02 
 
 
282 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  36.9 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  32.35 
 
 
286 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  36.63 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  33.65 
 
 
290 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  29.85 
 
 
278 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  33.51 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  36.31 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  35.23 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  38.18 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  35.71 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  36.42 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  32.44 
 
 
294 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  36.41 
 
 
305 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  36.11 
 
 
288 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  39.53 
 
 
306 aa  93.2  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  35.63 
 
 
294 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  35.68 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  34.78 
 
 
269 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  33.17 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  35.87 
 
 
297 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  36.97 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  37.57 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  35.87 
 
 
297 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  36.05 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  34 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  36.16 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  35.87 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  35.87 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  32.66 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  33.7 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  33.7 
 
 
289 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  35.87 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  38.6 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  35.87 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  33.83 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  35.87 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  35.87 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  35.87 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  32.66 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  35.87 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  37.41 
 
 
285 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  32.84 
 
 
290 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  36.87 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  35.63 
 
 
294 aa  89.7  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5493  parB-like partition protein  26.95 
 
 
311 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  33.92 
 
 
294 aa  89.4  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  33.16 
 
 
290 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  32.09 
 
 
293 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  38.46 
 
 
303 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  32.79 
 
 
286 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  33.67 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  32.69 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  35.52 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  33.82 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  33.82 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  36.07 
 
 
295 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  35.03 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  38.69 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  34.78 
 
 
310 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  33.16 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  28.92 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  36.42 
 
 
315 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  33.86 
 
 
292 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  33.73 
 
 
291 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  33.33 
 
 
283 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  31.03 
 
 
281 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  33.04 
 
 
281 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  35.16 
 
 
299 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  32.26 
 
 
281 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  38.01 
 
 
297 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  29.29 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  30.23 
 
 
305 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  32.43 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  32.14 
 
 
281 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  30.77 
 
 
297 aa  86.3  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  36.63 
 
 
286 aa  86.3  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  31.02 
 
 
293 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  30.73 
 
 
304 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  31.16 
 
 
298 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  34.91 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  35.03 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  36.69 
 
 
321 aa  85.9  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  35.2 
 
 
301 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  34.22 
 
 
283 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  35.2 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  33.16 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  30.68 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  33.52 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  34.78 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  30.26 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  33.91 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  36.47 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  32.43 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>