260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4090 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  100 
 
 		 333 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  54.95 
 
 		 335 aa  351  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  54.46 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  53.87 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  50.63 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  50.58 
 
 		 347 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  45.24 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  47.8 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  42.82 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  43.15 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  41.52 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  42.99 
 
 		 336 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  45.33 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  43.67 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  39.65 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  40.91 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  39.88 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  42.81 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  42.16 
 
 		 331 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  44.24 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  41.49 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  41.49 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  38.91 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  46.74 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  43.71 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  42.5 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  38.58 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  39.7 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  41.58 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  42.16 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  42.71 
 
 		 353 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  37.91 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  42 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  39.38 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  36.65 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  38.49 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  35.67 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  42.98 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  40.48 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  39.47 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  37.14 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  38.66 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  35.5 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  33.55 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  37.25 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  35.46 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  37.06 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  40.1 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  42.86 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  44.16 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  30.13 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  38.14 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  32 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  40.79 
 
 		 607 aa  59.7  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  34.65 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  24.24 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  34.23 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  25.95 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  34.23 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  32.65 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  32.43 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  31.29 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  31.29 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  31.29 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  30.87 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5568  parB-like partition protein  33.88 
 
 		 552 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5971  parB-like partition proteins  33.88 
 
 		 552 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.8 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  23.87 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  35.9 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  32.12 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  35.9 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  41.86 
 
 		 549 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  23.23 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  33.87 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  33.87 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  31.94 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  30.25 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  33.07 
 
 		 605 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  30.61 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  31.08 
 
 		 391 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  28.57 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  29.82 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  32.56 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  30.2 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  33.62 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  32.19 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  36.05 
 
 		 572 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  32.06 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  32.26 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  28 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  32.06 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  30 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  34.23 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>