33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4243 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  73.24 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  73.3 
 
 		 368 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  40.85 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  52.94 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  42.33 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  41.46 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  41.46 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  41.98 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  37.86 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  38.64 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  39.69 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  38.52 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  36.79 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  32.08 
 
 		 369 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  36.24 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  30.25 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  32.12 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  32.68 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  31.18 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  32.68 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  34.69 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  37.27 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  35.4 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  34.59 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  31.75 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  31.25 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  28.86 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  27.94 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  28.66 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  30.97 
 
 		 281 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  34.29 
 
 		 274 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  36.09 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>