63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3691 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  84.96 
 
 		 361 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  85.24 
 
 		 361 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  50.97 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  50 
 
 		 360 aa  268  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  45.09 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  46.88 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  47.06 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  44.11 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  40.2 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  38.4 
 
 		 281 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  46.6 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  42.72 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  42.72 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  43.37 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  35.09 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.88 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  36.36 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  29.49 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  31.4 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  35.61 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.05 
 
 		 256 aa  53.5  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  30.16 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  29.94 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  31.58 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  32.85 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  33.85 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  29.89 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  32.85 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  29.37 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  32.61 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  29.37 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  36.94 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  29.66 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1762  parB-like partition protein  33.61 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  33.62 
 
 		 583 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  36.46 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  29.84 
 
 		 347 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  38.54 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  34.19 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  40 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  36.52 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  36.17 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  28.21 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  32.04 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  33.07 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  35.14 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  27.63 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  30.85 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  38.54 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  35.42 
 
 		 283 aa  43.1  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  29.65 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  31.76 
 
 		 289 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.45 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  30.63 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  34.88 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>