193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2588 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  100 
 
 
447 aa  921    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3038  transcriptional regulator protein  31.71 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3640  ParB-like nuclease  25.11 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4529  nuclease  33.16 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2187  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.7 
 
 
133 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  36.73 
 
 
268 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1278  nuclease  28.72 
 
 
288 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2122  nuclease  28.72 
 
 
288 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  39.51 
 
 
294 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0756  hypothetical protein  36.46 
 
 
133 aa  57.8  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  29.08 
 
 
285 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  33.8 
 
 
280 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  34.15 
 
 
294 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  28.39 
 
 
278 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  34.25 
 
 
282 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  38.95 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  29.69 
 
 
256 aa  55.1  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  36.36 
 
 
299 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  38.46 
 
 
287 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  40.98 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6316  chromosome partitioning protein ParB  26.03 
 
 
332 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0644  ParB domain protein nuclease  29.76 
 
 
271 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6720  hypothetical protein  40.26 
 
 
174 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  19.86 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  39.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  31.34 
 
 
296 aa  53.9  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  40.98 
 
 
409 aa  53.5  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  40 
 
 
422 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  33.98 
 
 
293 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  35.45 
 
 
281 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  33.61 
 
 
283 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  38.38 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  34.88 
 
 
268 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  38.71 
 
 
283 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  36.59 
 
 
409 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  35.35 
 
 
290 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  28.26 
 
 
213 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  39.13 
 
 
281 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  38.89 
 
 
281 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  31.58 
 
 
361 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  33.65 
 
 
286 aa  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  30.7 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06610  ParB-like nuclease  33.33 
 
 
336 aa  51.2  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  23.33 
 
 
396 aa  51.2  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  43.9 
 
 
261 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  30.7 
 
 
361 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  34.62 
 
 
304 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  36.36 
 
 
302 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  30.82 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  35.71 
 
 
283 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  34.34 
 
 
290 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00240  ParB-like nuclease  29.63 
 
 
336 aa  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  32.56 
 
 
281 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  34.88 
 
 
295 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  39.08 
 
 
305 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  27.31 
 
 
290 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  34.86 
 
 
324 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  27.31 
 
 
290 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  32.61 
 
 
314 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  37.65 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  35.85 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  35.35 
 
 
290 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  32.11 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  33.67 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.36 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  27.31 
 
 
290 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  26.71 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  36.27 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  40.26 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  38.55 
 
 
313 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  34.44 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  35.85 
 
 
529 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  36.96 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.65 
 
 
274 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  33.33 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  42.67 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  26.85 
 
 
290 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  36.89 
 
 
272 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  33.33 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1453  parB-like partition protein  32.64 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  42.67 
 
 
284 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1166  nuclease  40.85 
 
 
79 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  31.07 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  25.25 
 
 
282 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  28.57 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  34.29 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  23.55 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  26.85 
 
 
290 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  33.33 
 
 
296 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  39.8 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  33.04 
 
 
304 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  34.51 
 
 
294 aa  47.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  39.8 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  34.12 
 
 
282 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  31.71 
 
 
273 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  39.8 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0826  ParB domain protein nuclease  37.23 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  33.03 
 
 
290 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  33.03 
 
 
290 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  33.03 
 
 
290 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>