41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4529 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4529  nuclease  100 
 
 
270 aa  534  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2122  nuclease  37.05 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1278  nuclease  37.05 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0644  ParB domain protein nuclease  39.33 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3038  transcriptional regulator protein  32 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  33.16 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  34.25 
 
 
435 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06610  ParB-like nuclease  29.56 
 
 
336 aa  55.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  34.95 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00240  ParB-like nuclease  35.05 
 
 
336 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  28.83 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  34.91 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  33.04 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  33.33 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  29.63 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  35.35 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  27.98 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  31.11 
 
 
286 aa  46.2  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  37.62 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  37.62 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  37.62 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  28.17 
 
 
286 aa  45.4  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  33.33 
 
 
358 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  24.02 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  34.44 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.36 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  33.33 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  30.16 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  30.16 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0527  ParB family protein  28.17 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  25.54 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  36.47 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  29.2 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  29.57 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  31.54 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  33.65 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  30.84 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  30.83 
 
 
401 aa  42.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22180  parB-like partition protein  34.44 
 
 
314 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  34.02 
 
 
281 aa  42  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0826  ParB domain protein nuclease  37.5 
 
 
333 aa  42  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>