170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0826 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0826  ParB domain protein nuclease  100 
 
 
333 aa  660    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00240  ParB-like nuclease  46.5 
 
 
336 aa  228  8e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06610  ParB-like nuclease  43.63 
 
 
336 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0756  hypothetical protein  37.23 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2187  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.96 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3031  ParB domain protein nuclease  40 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12665  hypothetical protein  44.58 
 
 
154 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.39723e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  42.59 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  34.33 
 
 
447 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1166  nuclease  41.79 
 
 
79 aa  56.6  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  42.39 
 
 
401 aa  56.6  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  35.29 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  41.11 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  34.55 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  43.96 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  34.78 
 
 
278 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  39.77 
 
 
285 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  33.87 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  34.78 
 
 
278 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  34.78 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  40.22 
 
 
279 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  40.22 
 
 
279 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  38.2 
 
 
294 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  41.18 
 
 
286 aa  52.8  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  33.94 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  28.04 
 
 
273 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1162  ParB-like nuclease domain-containing protein  35.79 
 
 
542 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  34.07 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  42.27 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  38.05 
 
 
268 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  39.33 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  36 
 
 
286 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  36.17 
 
 
281 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  40 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  37.14 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  41.86 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  37.5 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1762  parB-like partition protein  33.07 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  39.77 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  34.69 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  38.32 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3186  parB-like partition protein  42.55 
 
 
350 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000842796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  37.08 
 
 
422 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  39.25 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  31.15 
 
 
280 aa  50.1  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  40.22 
 
 
279 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  35.24 
 
 
272 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  39.56 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  35.71 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.05 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  36.26 
 
 
565 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  39.58 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  34.48 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  36.36 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  33.96 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  39.08 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  39.78 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  38.54 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  35.71 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  33.62 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  30.84 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  29.85 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.05 
 
 
279 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  36.61 
 
 
362 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  38.1 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  37.74 
 
 
383 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  41.86 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  35.09 
 
 
304 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  38.3 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  30.19 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  38.46 
 
 
314 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  32.56 
 
 
377 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  38.54 
 
 
305 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  39.33 
 
 
398 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  34.44 
 
 
281 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  36.36 
 
 
286 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  38.54 
 
 
297 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  38.54 
 
 
295 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  34.88 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  38.54 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  38.54 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  36.89 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  34.62 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  32.11 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  32.11 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  37.5 
 
 
296 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  36.45 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  38.54 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  35.87 
 
 
299 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  38.54 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  36.05 
 
 
294 aa  46.6  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>