More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2024 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  41.14 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.52 
 
 
298 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.52 
 
 
298 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  44.22 
 
 
298 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1453  parB-like partition protein  30.92 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  43.12 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  40.51 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  41.98 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  41.51 
 
 
298 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  42.57 
 
 
281 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  43.51 
 
 
292 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  41.96 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  44.06 
 
 
279 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  42.57 
 
 
282 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  43.54 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  41.48 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  36.99 
 
 
305 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  39.13 
 
 
299 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  44.27 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  37.43 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  41.26 
 
 
281 aa  112  8.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  43.51 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  41.1 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  43.51 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  44.29 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  40.13 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.14 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  40.69 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  36.31 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  41.29 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  43.57 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 
290 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  42.75 
 
 
296 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 
290 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  45.27 
 
 
292 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  44.22 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  40.91 
 
 
281 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  40.56 
 
 
303 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  42.95 
 
 
422 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  39.86 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  41.98 
 
 
290 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  38.26 
 
 
269 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  40 
 
 
283 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  38.46 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  36.9 
 
 
297 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  37.21 
 
 
294 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.26 
 
 
286 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  43.36 
 
 
294 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  39.88 
 
 
319 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  40.41 
 
 
288 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  40.14 
 
 
288 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.24 
 
 
290 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  40.15 
 
 
281 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  39.16 
 
 
367 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  40.46 
 
 
293 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.48 
 
 
294 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  37.5 
 
 
280 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  41.35 
 
 
293 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  40.6 
 
 
293 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  40.6 
 
 
293 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  35.71 
 
 
296 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.57 
 
 
290 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  38.31 
 
 
301 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  42.66 
 
 
295 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.57 
 
 
290 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  41.96 
 
 
268 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.14 
 
 
284 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  36.3 
 
 
297 aa  105  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  42.96 
 
 
305 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  40.58 
 
 
317 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  40 
 
 
268 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  40.28 
 
 
293 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  39.69 
 
 
293 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.76 
 
 
281 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  41.43 
 
 
274 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  40 
 
 
282 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40.56 
 
 
285 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  40.22 
 
 
294 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  37.75 
 
 
294 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  37.65 
 
 
292 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  37.65 
 
 
292 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  39.31 
 
 
301 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 
296 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  44.06 
 
 
284 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  37.65 
 
 
292 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  38.19 
 
 
293 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.28 
 
 
290 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  40.54 
 
 
257 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  42.36 
 
 
287 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  39.73 
 
 
401 aa  102  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  37.11 
 
 
306 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  40.54 
 
 
315 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  35.09 
 
 
286 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  39.86 
 
 
304 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>