More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2187 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2187  ParB-like nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  258  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0756  hypothetical protein  45.74 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0826  ParB domain protein nuclease  43.96 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00240  ParB-like nuclease  37.25 
 
 		 336 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  42.7 
 
 		 447 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  38.32 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06610  ParB-like nuclease  41.46 
 
 		 336 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  42.59 
 
 		 286 aa  62  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  41.41 
 
 		 314 aa  60.1  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  42.06 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  37.38 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  39.82 
 
 		 280 aa  57.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  40.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  40 
 
 		 281 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  38.53 
 
 		 324 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  37.89 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3031  ParB domain protein nuclease  37.35 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  43.01 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  40.57 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  34.26 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  36.54 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  37.36 
 
 		 290 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  35.19 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  34.58 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  36.28 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  36.11 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  41.86 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  36.05 
 
 		 305 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  36.28 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  37.36 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  37.36 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  36.28 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  34.23 
 
 		 298 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  37.36 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  37.36 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  33.96 
 
 		 293 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  41.05 
 
 		 278 aa  53.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  41.05 
 
 		 278 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  41.05 
 
 		 278 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  35.4 
 
 		 294 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  35.71 
 
 		 299 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1166  nuclease  40.28 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  36.28 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 303 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  35.71 
 
 		 299 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  42.67 
 
 		 362 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  33.64 
 
 		 298 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  32.08 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  35.4 
 
 		 290 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  36.9 
 
 		 324 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  38.95 
 
 		 319 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  35.4 
 
 		 290 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  39.53 
 
 		 283 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  35.19 
 
 		 294 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  32.71 
 
 		 296 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  32.74 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  35.4 
 
 		 290 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  33.96 
 
 		 279 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4808  nuclease  32.43 
 
 		 306 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  35.45 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  35.79 
 
 		 286 aa  51.2  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12665  hypothetical protein  40.26 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.39723e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  31.78 
 
 		 321 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  33.96 
 
 		 279 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22180  parB-like partition protein  38.78 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  37.37 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  34.69 
 
 		 368 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2626  hypothetical protein  30.72 
 
 		 274 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0898981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  33.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  34.91 
 
 		 293 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  38.82 
 
 		 409 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 290 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  34.45 
 
 		 299 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  34.48 
 
 		 422 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  35.29 
 
 		 290 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  33.64 
 
 		 290 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  33.64 
 
 		 290 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  33.02 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  35.14 
 
 		 300 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6720  hypothetical protein  43.24 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6266  nuclease  29.29 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  37.18 
 
 		 323 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  33.96 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 290 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  33.02 
 
 		 278 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  39.08 
 
 		 257 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  36.7 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  35.29 
 
 		 290 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  36.7 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  35.51 
 
 		 291 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  34.31 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  31.13 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 309 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  32.73 
 
 		 296 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  33.03 
 
 		 328 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  34.51 
 
 		 280 aa  48.9  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>