More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2983 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  100 
 
 		 299 aa  597  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  80.2 
 
 		 299 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  80.2 
 
 		 299 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  69.76 
 
 		 300 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  66.21 
 
 		 303 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  67.16 
 
 		 213 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4808  nuclease  45.8 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0527  ParB family protein  46.03 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3813  ParB-like nuclease  45.18 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3502  RepB plasmid partition  44.85 
 
 		 302 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.884798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0831  parB-like partition protein  41.22 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0033  ParB family protein  41.38 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  40.5 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0771  ParB family protein  33.79 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  34.29 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  34.29 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  34.29 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  33.21 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2747  stage 0 sporulation protein J, putative  45.53 
 
 		 136 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  35.67 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  30.57 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  40.95 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  32.35 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  30.86 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  43.48 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  41.51 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  30.86 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  34.72 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  34.72 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  34.72 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  31.72 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  34.51 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  34.27 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  32.35 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  40.4 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  35.65 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  32.74 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.74 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  40.18 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.74 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  31.58 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.74 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  32.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  33.12 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  32.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  32.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  32.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  32.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  34.78 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  32.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  30 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  31.84 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  32.14 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  32.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  27.81 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  35.54 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  33.04 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  29.47 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  34.48 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  31.78 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  29.89 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  32.14 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  31.69 
 
 		 668 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  33.58 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  30.72 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  27.88 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  31.28 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  30.05 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  37 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  30.3 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  31.28 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  30.73 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  26.82 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  32.95 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  30.97 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  34.71 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  33.79 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  34.71 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  31.91 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  28.82 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  29.21 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  33.8 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  28.82 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  35.29 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  28.28 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.57 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  29.21 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  32.17 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  29.56 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  29.76 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  30.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  29.02 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  37.5 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  33.56 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  30.99 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>