More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0831 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0831  parB-like partition protein  100 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  92.71 
 
 
288 aa  544  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  44.76 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  44.37 
 
 
303 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  42.29 
 
 
299 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  42.29 
 
 
299 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  41.22 
 
 
299 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3813  ParB-like nuclease  42.45 
 
 
302 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3502  RepB plasmid partition  42.09 
 
 
302 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.884798  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4808  nuclease  42.34 
 
 
306 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0033  ParB family protein  39.07 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0527  ParB family protein  40.36 
 
 
299 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  51.49 
 
 
213 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  39.15 
 
 
298 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  39.15 
 
 
298 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  39.15 
 
 
298 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0771  ParB family protein  37.81 
 
 
296 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  38.95 
 
 
298 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2747  stage 0 sporulation protein J, putative  45.31 
 
 
136 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  28.36 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  30.48 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  32.42 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.85 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  31.94 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  31.29 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  35.04 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  31.54 
 
 
313 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  27.03 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  31.03 
 
 
299 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  31.9 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  33.57 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.87 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  27.51 
 
 
565 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.61 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  34.78 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.89 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  35.11 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  35.11 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  29.53 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  30 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  30.77 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  35.11 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  32.19 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  37.07 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  33.62 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  33.9 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  33.9 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  31.25 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  29.38 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  31.41 
 
 
597 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  28.08 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  38.24 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  28.08 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  31.29 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  29.73 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  33.9 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  34.09 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  29.45 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  25.11 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  31.29 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  27.16 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  29.5 
 
 
303 aa  59.3  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  32.81 
 
 
306 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  30.77 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  31.71 
 
 
281 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  26.4 
 
 
597 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  32.76 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  26.38 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  35.9 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  35.9 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  30.47 
 
 
305 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  27.16 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  30.61 
 
 
368 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  30.77 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  32.19 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  30.47 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  24.87 
 
 
612 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  30.47 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  30.47 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  30.47 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  30.47 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  30.47 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  30.47 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  28.47 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  30.47 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  30.47 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  30.47 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  30.15 
 
 
362 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  31.76 
 
 
409 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  29.73 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  28.81 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  41.77 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  29.69 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  29.79 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  28.28 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  31.25 
 
 
579 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  27.7 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  31.25 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  30.72 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>