More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1403 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  100 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0831  parB-like partition protein  92.71 
 
 		 288 aa  544  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  45.07 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  44.68 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  41.79 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  41.79 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  40.5 
 
 		 299 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4808  nuclease  40.79 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3813  ParB-like nuclease  43.17 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3502  RepB plasmid partition  42.81 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.884798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0033  ParB family protein  38.71 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0527  ParB family protein  39.29 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  50.99 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  38.85 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  38.85 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  38.85 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0771  ParB family protein  38.54 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  36.99 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2747  stage 0 sporulation protein J, putative  45.31 
 
 		 136 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  29.79 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  37.27 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  29.53 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  31.3 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  31.39 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  39.22 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  40 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  40 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  28.26 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  30.61 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  34.85 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  30.61 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  30 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  31.9 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  30.82 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  30.77 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.06 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.87 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  35.34 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  38.2 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  29.53 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  29.05 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.73 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  29.45 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  34.19 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  28.42 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  32.03 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  36.21 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  30.77 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  31.25 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  29.45 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  34.19 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  30.77 
 
 		 597 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  31.87 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  30.88 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  29.17 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  34.35 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  35.34 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  30.47 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  30.47 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  35.63 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  30.47 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  30.47 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  30.47 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  30.47 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  40.51 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  28.42 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  30.47 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  30.47 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  28.97 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  34.35 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  28.42 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  31.03 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  30.47 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  34.35 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  31.9 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  30.47 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  30.47 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  38.2 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  31.33 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  32.76 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  28.66 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  27.66 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  38.2 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  38.2 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  37.08 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  37.5 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  29.69 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  33.9 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  32.03 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  32.86 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  30.14 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  27.97 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  28.93 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  32.81 
 
 		 579 aa  59.7  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  30.67 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>